MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sphingobium sp. SYK-6 chromosome

Total Repeats: 106501

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015976	CTG	2	6	38	43	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_015976	CTGTC	2	10	106	115	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3	NC_015976	ACCTGC	2	12	167	178	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	347526386
4	NC_015976	GGC	2	6	219	224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526386
5	NC_015976	AGC	2	6	284	289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526386
6	NC_015976	CAT	2	6	300	305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347526386
7	NC_015976	GGA	2	6	306	311	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347526386
8	NC_015976	AGC	2	6	379	384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526386
9	NC_015976	TCG	2	6	407	412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526386
10	NC_015976	CGC	2	6	413	418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526386
11	NC_015976	TCT	2	6	447	452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347526386
12	NC_015976	CCGGC	2	10	471	480	0 %	0 %	40 %	60 %	347526386
13	NC_015976	CG	3	6	510	515	0 %	0 %	50 %	50 %	347526386
14	NC_015976	ATG	3	9	545	553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347526386
15	NC_015976	GGA	2	6	573	578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347526386
16	NC_015976	ATCT	2	8	631	638	25 %	50 %	0 %	25 %	347526386
17	NC_015976	CGC	4	12	686	697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526386
18	NC_015976	GTC	2	6	727	732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526386
19	NC_015976	CGG	2	6	740	745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526386
20	NC_015976	GCT	2	6	780	785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526386
21	NC_015976	GC	3	6	853	858	0 %	0 %	50 %	50 %	347526386
22	NC_015976	TCGA	2	8	907	914	25 %	25 %	25 %	25 %	347526386
23	NC_015976	CGG	3	9	920	928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526386
24	NC_015976	GAA	2	6	957	962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347526386
25	NC_015976	CGC	2	6	966	971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526386
26	NC_015976	GCC	3	9	1036	1044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526387
27	NC_015976	CTG	2	6	1047	1052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526387
28	NC_015976	TGG	2	6	1078	1083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347526387
29	NC_015976	CGA	2	6	1094	1099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526387
30	NC_015976	GC	3	6	1138	1143	0 %	0 %	50 %	50 %	347526387
31	NC_015976	GCC	2	6	1284	1289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526387
32	NC_015976	CTG	2	6	1293	1298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526387
33	NC_015976	CG	3	6	1314	1319	0 %	0 %	50 %	50 %	347526387
34	NC_015976	GCG	2	6	1335	1340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526387
35	NC_015976	GCG	2	6	1354	1359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526387
36	NC_015976	GGT	2	6	1459	1464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347526387
37	NC_015976	GCT	2	6	1471	1476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526387
38	NC_015976	CTG	2	6	1551	1556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526387
39	NC_015976	CCAT	2	8	1662	1669	25 %	25 %	0 %	50 %	347526388
40	NC_015976	CTGG	2	8	1675	1682	0 %	25 %	50 %	25 %	347526388
41	NC_015976	TGC	2	6	1738	1743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526388
42	NC_015976	GC	3	6	1759	1764	0 %	0 %	50 %	50 %	347526388
43	NC_015976	CTGG	2	8	1774	1781	0 %	25 %	50 %	25 %	347526388
44	NC_015976	GCG	2	6	1839	1844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526388
45	NC_015976	CGGG	2	8	1887	1894	0 %	0 %	75 %	25 %	347526388
46	NC_015976	CGG	2	6	1921	1926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526388
47	NC_015976	TCC	2	6	1929	1934	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347526388
48	NC_015976	GCT	2	6	1939	1944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526388
49	NC_015976	GC	3	6	1946	1951	0 %	0 %	50 %	50 %	347526388
50	NC_015976	GGCAG	2	10	1956	1965	20 %	0 %	60 %	20 %	347526388
51	NC_015976	GCG	2	6	1989	1994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526388
52	NC_015976	GC	4	8	1997	2004	0 %	0 %	50 %	50 %	347526388
53	NC_015976	TCG	2	6	2049	2054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526388
54	NC_015976	CG	4	8	2053	2060	0 %	0 %	50 %	50 %	347526388
55	NC_015976	GCT	2	6	2080	2085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526388
56	NC_015976	CTG	2	6	2147	2152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526388
57	NC_015976	TCC	2	6	2159	2164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347526388
58	NC_015976	GCC	2	6	2185	2190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526388
59	NC_015976	GC	3	6	2206	2211	0 %	0 %	50 %	50 %	347526388
60	NC_015976	GTC	2	6	2228	2233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526388
61	NC_015976	CGC	2	6	2272	2277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526388
62	NC_015976	GC	6	12	2279	2290	0 %	0 %	50 %	50 %	347526388
63	NC_015976	GGC	2	6	2332	2337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526388
64	NC_015976	TCT	2	6	2352	2357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347526388
65	NC_015976	CGATGC	2	12	2359	2370	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	347526388
66	NC_015976	CG	4	8	2373	2380	0 %	0 %	50 %	50 %	347526388
67	NC_015976	CGCC	2	8	2412	2419	0 %	0 %	25 %	75 %	347526388
68	NC_015976	CCG	2	6	2423	2428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_015976	GATC	2	8	2466	2473	25 %	25 %	25 %	25 %	347526389
70	NC_015976	CCG	2	6	2487	2492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526389
71	NC_015976	ATG	2	6	2501	2506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347526389
72	NC_015976	GC	3	6	2571	2576	0 %	0 %	50 %	50 %	347526389
73	NC_015976	GC	3	6	2594	2599	0 %	0 %	50 %	50 %	347526389
74	NC_015976	CAC	2	6	2608	2613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347526389
75	NC_015976	GCGG	2	8	2618	2625	0 %	0 %	75 %	25 %	347526389
76	NC_015976	GC	3	6	2646	2651	0 %	0 %	50 %	50 %	347526389
77	NC_015976	GGC	2	6	2677	2682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526389
78	NC_015976	GC	3	6	2717	2722	0 %	0 %	50 %	50 %	347526389
79	NC_015976	TGC	2	6	2760	2765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526389
80	NC_015976	CTG	2	6	2777	2782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526389
81	NC_015976	GTC	2	6	2822	2827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526389
82	NC_015976	TCC	2	6	2841	2846	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347526389
83	NC_015976	GCC	2	6	2850	2855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526389
84	NC_015976	GC	3	6	2885	2890	0 %	0 %	50 %	50 %	347526389
85	NC_015976	CCG	2	6	2893	2898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526389
86	NC_015976	GCCA	2	8	2906	2913	25 %	0 %	25 %	50 %	347526389
87	NC_015976	GC	6	12	2932	2943	0 %	0 %	50 %	50 %	347526389
88	NC_015976	TTGC	2	8	3006	3013	0 %	50 %	25 %	25 %	347526389
89	NC_015976	TCG	2	6	3126	3131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526390
90	NC_015976	TG	3	6	3140	3145	0 %	50 %	50 %	0 %	347526390
91	NC_015976	GC	3	6	3202	3207	0 %	0 %	50 %	50 %	347526390
92	NC_015976	CGG	2	6	3216	3221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526390
93	NC_015976	GCC	2	6	3284	3289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526390
94	NC_015976	GCT	2	6	3292	3297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526390
95	NC_015976	CGA	2	6	3310	3315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526390
96	NC_015976	TGG	2	6	3321	3326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347526390
97	NC_015976	ATCG	2	8	3488	3495	25 %	25 %	25 %	25 %	347526390
98	NC_015976	GCT	2	6	3535	3540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526390
99	NC_015976	TGG	2	6	3591	3596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347526390
100	NC_015976	TGGC	2	8	3648	3655	0 %	25 %	50 %	25 %	347526390
101	NC_015976	CG	3	6	3656	3661	0 %	0 %	50 %	50 %	347526390
102	NC_015976	CCGCC	2	10	3668	3677	0 %	0 %	20 %	80 %	347526390
103	NC_015976	GC	3	6	3704	3709	0 %	0 %	50 %	50 %	347526390
104	NC_015976	AAG	3	9	3817	3825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015976	TGTCA	2	10	4001	4010	20 %	40 %	20 %	20 %	347526391
106	NC_015976	CAC	2	6	4055	4060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347526391
107	NC_015976	GCC	2	6	4073	4078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526391
108	NC_015976	AGC	2	6	4092	4097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526391
109	NC_015976	GCC	2	6	4113	4118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526391
110	NC_015976	CCG	2	6	4140	4145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526391
111	NC_015976	GCGAC	2	10	4161	4170	20 %	0 %	40 %	40 %	347526391
112	NC_015976	CGA	2	6	4180	4185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526391
113	NC_015976	GTC	2	6	4196	4201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526391
114	NC_015976	GGA	2	6	4228	4233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347526391
115	NC_015976	GGT	2	6	4249	4254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347526391
116	NC_015976	TGA	2	6	4305	4310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347526391
117	NC_015976	GCT	2	6	4336	4341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526391
118	NC_015976	CCG	2	6	4381	4386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526391
119	NC_015976	C	6	6	4415	4420	0 %	0 %	0 %	100 %	347526391
120	NC_015976	CGG	2	6	4431	4436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_015976	GAT	2	6	4444	4449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015976	GCGGG	2	10	4450	4459	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
123	NC_015976	CTCG	2	8	4471	4478	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
124	NC_015976	ACCCC	2	10	4505	4514	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
125	NC_015976	CGG	3	9	4519	4527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_015976	CAT	2	6	4617	4622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_015976	GCC	2	6	4629	4634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_015976	CAA	2	6	4712	4717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347526392
129	NC_015976	AGC	2	6	4720	4725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526392
130	NC_015976	CGG	3	9	4829	4837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526392
131	NC_015976	ATC	2	6	4864	4869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347526392
132	NC_015976	CGT	3	9	4886	4894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526392
133	NC_015976	CGA	2	6	4928	4933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526392
134	NC_015976	TGC	2	6	4957	4962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526392
135	NC_015976	GCG	2	6	4978	4983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526392
136	NC_015976	CTG	2	6	5019	5024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526392
137	NC_015976	CGG	2	6	5093	5098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526392
138	NC_015976	CG	3	6	5155	5160	0 %	0 %	50 %	50 %	347526393
139	NC_015976	GC	3	6	5182	5187	0 %	0 %	50 %	50 %	347526393
140	NC_015976	TCCC	2	8	5202	5209	0 %	25 %	0 %	75 %	347526393
141	NC_015976	GC	3	6	5236	5241	0 %	0 %	50 %	50 %	347526393
142	NC_015976	CGG	2	6	5277	5282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526393
143	NC_015976	CAC	2	6	5370	5375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347526393
144	NC_015976	CCGGT	2	10	5411	5420	0 %	20 %	40 %	40 %	347526393
145	NC_015976	GCG	2	6	5451	5456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526393
146	NC_015976	GCGAGG	2	12	5489	5500	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	347526393
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148	NC_015976	CGGCAC	2	12	5511	5522	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	347526393
149	NC_015976	CCA	2	6	5534	5539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347526393
150	NC_015976	AGC	2	6	5580	5585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526393
151	NC_015976	CGA	2	6	5590	5595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526394
152	NC_015976	GC	3	6	5621	5626	0 %	0 %	50 %	50 %	347526394
153	NC_015976	GGC	2	6	5640	5645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526394
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155	NC_015976	ACTC	2	8	5765	5772	25 %	25 %	0 %	50 %	347526394
156	NC_015976	ATG	2	6	5808	5813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347526394
157	NC_015976	AT	3	6	5816	5821	50 %	50 %	0 %	0 %	347526394
158	NC_015976	CGC	3	9	5891	5899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526394
159	NC_015976	GCT	2	6	5910	5915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526394
160	NC_015976	G	6	6	6008	6013	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
161	NC_015976	ACT	2	6	6103	6108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347526395
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163	NC_015976	GTC	2	6	6141	6146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526395
164	NC_015976	GCTG	2	8	6156	6163	0 %	25 %	50 %	25 %	347526395
165	NC_015976	GCCG	2	8	6180	6187	0 %	0 %	50 %	50 %	347526395
166	NC_015976	TTCCGG	2	12	6227	6238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526395
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172	NC_015976	GC	3	6	6394	6399	0 %	0 %	50 %	50 %	347526395
173	NC_015976	GTC	2	6	6436	6441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526395
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175	NC_015976	CCA	2	6	6470	6475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347526395
176	NC_015976	GCG	2	6	6482	6487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526395
177	NC_015976	GTC	2	6	6527	6532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526395
178	NC_015976	ACCGC	2	10	6550	6559	20 %	0 %	20 %	60 %	347526395
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181	NC_015976	CTTGTT	2	12	6749	6760	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
182	NC_015976	CG	3	6	6855	6860	0 %	0 %	50 %	50 %	347526396
183	NC_015976	CGG	2	6	6926	6931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526396
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195	NC_015976	CGC	2	6	7331	7336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
196	NC_015976	GCT	2	6	7455	7460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
197	NC_015976	GTCCG	2	10	7483	7492	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
198	NC_015976	GA	3	6	7522	7527	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
199	NC_015976	CCG	2	6	7558	7563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526397
200	NC_015976	CTGGA	2	10	7665	7674	20 %	20 %	40 %	20 %	347526397
201	NC_015976	CGA	2	6	7709	7714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526397
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229	NC_015976	TAT	2	6	8715	8720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347526397
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232	NC_015976	CGG	2	6	8777	8782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526397
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234	NC_015976	GTC	2	6	8865	8870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526397
235	NC_015976	CTT	2	6	8972	8977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347526397
236	NC_015976	GAC	2	6	9072	9077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526397
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238	NC_015976	CGG	2	6	9109	9114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526397
239	NC_015976	GC	3	6	9124	9129	0 %	0 %	50 %	50 %	347526397
240	NC_015976	TCG	2	6	9130	9135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526397
241	NC_015976	GGC	2	6	9155	9160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526397
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243	NC_015976	GAT	2	6	9237	9242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347526397
244	NC_015976	GC	3	6	9248	9253	0 %	0 %	50 %	50 %	347526397
245	NC_015976	CCTGC	2	10	9321	9330	0 %	20 %	20 %	60 %	347526397
246	NC_015976	ATC	2	6	9439	9444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347526397
247	NC_015976	CCG	3	9	9478	9486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
248	NC_015976	CG	4	8	9485	9492	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
249	NC_015976	CGGCG	2	10	9508	9517	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
250	NC_015976	CG	3	6	9516	9521	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
251	NC_015976	TCAG	2	8	9601	9608	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
252	NC_015976	GA	3	6	9680	9685	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
253	NC_015976	CCGCG	2	10	9721	9730	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
254	NC_015976	CGT	2	6	9833	9838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526398
255	NC_015976	CG	3	6	9882	9887	0 %	0 %	50 %	50 %	347526398
256	NC_015976	GGC	2	6	9951	9956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526398
257	NC_015976	CGC	2	6	10039	10044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526398
258	NC_015976	CTC	2	6	10047	10052	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347526398
259	NC_015976	AGCTG	2	10	10075	10084	20 %	20 %	40 %	20 %	347526398
260	NC_015976	GC	3	6	10140	10145	0 %	0 %	50 %	50 %	347526398
261	NC_015976	CG	3	6	10157	10162	0 %	0 %	50 %	50 %	347526398
262	NC_015976	GGA	4	12	10184	10195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347526398
263	NC_015976	CGGC	2	8	10246	10253	0 %	0 %	50 %	50 %	347526398
264	NC_015976	GCT	2	6	10280	10285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526398
265	NC_015976	GGC	2	6	10368	10373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526398
266	NC_015976	TTC	2	6	10374	10379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347526398
267	NC_015976	CG	3	6	10417	10422	0 %	0 %	50 %	50 %	347526398
268	NC_015976	GGGC	2	8	10468	10475	0 %	0 %	75 %	25 %	347526398
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393	NC_015976	CGGC	2	8	15168	15175	0 %	0 %	50 %	50 %	347526400
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402	NC_015976	TCC	2	6	15494	15499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347526400
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482	NC_015976	GCC	2	6	18489	18494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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497	NC_015976	CGG	2	6	19374	19379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526404
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